该片讲述的是一名在客服中心工作的聋哑人“京美”（秦基周饰）在午夜偶然遇到连环杀人魔“度植”（魏化儁饰）而展开的深夜追击战。。尼奥（基努·里维斯 Keanu Reeves 饰）和崔妮蒂（凯瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰）重回矩阵：在这里，一个是矩阵创造出来，周而复始的日常世界，另一个则是隐藏其后，真实的人类世界。为了弄清楚自己所处的“现实”究竟是真是假，尼奥不得不再次做出选择……。