秦天一行人逃离沉没的荒岛后，来到另一个巨大的岛屿，这里到处遍布着玛雅时代的遗迹，以及更加神秘的氏族，经历一番艰险磨难，他们终于找到了这一切的真相。时空之路、生态实验室……一切的隐秘将在此交汇。。电影以1876年－1877年中的西南战争和明治维新作为背景，描述一个前美国军人，到日本助明治新政而组建的日本新军做教官，在战争途中被俘，慢慢被日本传统文化所吸引。。
